既沒(méi)有大城市那般的嘈雜，也沒(méi)有郊外般閑暇的街道，祖師谷大藏。憧憬著(zhù)怪獸娘們的組織“GIRLS”的同時(shí)，又是一名極其平凡地度過(guò)每一天的女高中生·平賀冴月。某一天，因為覺(jué)醒了不可思議力量而困惑的冴月，拯救了她的并不是她所憧憬的“GIRLS”而是自稱(chēng)為布萊克指揮官的怪獸娘所率領(lǐng)的邪惡軍團“BLACK STARS（暗黑群星）”??？

　　在查莫斯大陸里面有一個(gè)哥達國，而他的統治者是國王胡加13世，在查莫斯大陸的南部，就是哥達國首都的背面，有一個(gè)小村叫做夷美拉村，在這個(gè)村里面，流傳著(zhù)一個(gè)特別的故事，一個(gè)關(guān)于怪獸的故事：原來(lái)所謂的怪獸，是一只會(huì )飛的、他的雙眼會(huì )放出攻擊光線(xiàn)、口會(huì )噴出烈火、而他的鼻子可以噴出毒氣、他還可以使出無(wú)影拳打人、又可以使出無(wú)影腳踩爛地下、他的尾巴還會(huì )放出讓白飯變壞的光線(xiàn)、而他最厲害的是好象臭鼬鼠般發(fā)出難聞的臭味，在夷美拉村的人就叫他咕嚕咕嚕，而且當他是可怕的魔神供養，絕對不希望他再出現。某一天在夷美拉村子里，四個(gè)小孩在魔法婆婆的圈禁加武力威脅之下聽(tīng)她講那老套的關(guān)于魔王的故事：很久很久以前， 當時(shí)的國王仍然是胡加13世，有一個(gè)叫吉利的魔王使用黑暗魔法并召集了許多可怕的妖怪，在魔法戰爭中光明魔法也無(wú)法與之抗衡，于是國王就找到了同樣使用黑暗魔法但是屬于光明陣營(yíng)的神秘族人幫忙終于封印了魔王。但是封印的效果只有300年，300年后，魔王將會(huì )再度復活降臨世界。

2029年3月某日，某國大使館遭到一群經(jīng)大規模義體改造的武裝分子的入侵，眾多外國使節及其同儕眷屬淪為人質(zhì)，事態(tài)十萬(wàn)火急。草薙素子（坂本真綾 配音）召集巴特（松田健一郎 配音）、陀古薩（新垣樽助 配音）等得力屬下，并制定了周密的營(yíng)救計劃。誰(shuí)知當一切都按部就班進(jìn)行之時(shí)，意外突然發(fā)生。與此同時(shí)，距離大使館不遠的一座摩天大樓內，日本首相遭到密碼箱炸彈的暗殺，素子之前的上司陸軍501機關(guān)的機關(guān)長(cháng)庫露茲（淺野麻由美 飾）也在爆炸中喪生。經(jīng)過(guò)縝密追查，素子等人發(fā)現一種能夠篡改記憶的病毒正在網(wǎng)絡(luò )蔓延，而她的身世居然和一連串的事件有著(zhù)密切聯(lián)系。危機當前，陰謀悄然復出水面……
　　本片根據士郎正宗的同名原作改編，系《攻殼機動(dòng)隊》誕生25周年紀念作品