幼時(shí)曾深陷絕望深淵的直枝理樹(shù)，與4位少年少女相遇了。

由于童年的悲慘遭遇，直枝理樹(shù)（堀江由衣 配音）的個(gè)性變得十分孤僻。長(cháng)著(zhù)一張娃娃臉，沉默寡言，沒(méi)有朋友，這樣的理樹(shù)成為了大家眼里的怪胎。某一日，性格傲嬌愛(ài)貓如命的棗鈴（民安智惠 配音），正直開(kāi)朗穩重可靠的棗恭介（綠川光 配音），四肢發(fā)達頭腦簡(jiǎn)單的井之原真人（神奈延年 配音），成熟勇敢劍術(shù)一流的宮澤謙吾（織田優(yōu)成 配音）四人出現在了絕望的理樹(shù)面前。他們自稱(chēng)“Little Busters”，想要利用理樹(shù)的力量來(lái)完成拯救世界的重任。就這樣，理樹(shù)成為了LB中的一份子，整日奔波解決一些說(shuō)來(lái)宏大但其實(shí)十分平凡的委托。在相處的過(guò)程中，本來(lái)行為舉止十分怪異的同伴們漸漸的變得可愛(ài)起來(lái)，理樹(shù)也逐漸敞開(kāi)了緊閉的心門(mén)，找回了久違的快樂(lè )。他開(kāi)始明白，只要有一顆開(kāi)朗向上的心，這樣的生活一定能夠繼續下去直到永遠。

　　在《納米核心》的里世界中，各位主角配角以及龍套們，都要在“納米學(xué)院”中學(xué)習生活。大家在這個(gè)世界不那么認真地上課、考試、過(guò)著(zhù)奇奇怪怪的校園日常，并不正經(jīng)地保護著(zhù)這個(gè)世界，以及不停地用各自的方式向大家“表示友好”。

　　阿斯嘉特大戰已經(jīng)過(guò)去五年，世界在金蝰蛇和“東安聯(lián)”的支配下，維持著(zhù)虛假而脆弱的和平。瑞為了復活赫雅重現商都，試圖找到被金蝰蛇集團獨吞的“圣柜線(xiàn)索”。然而一個(gè)與II型文明息息相關(guān)的神秘組織“黃昏使者”，早已經(jīng)盯上了圣柜和瑞......

　　在距離東京南部一千公里的小宅島上，一家豪華酒店將迎來(lái)開(kāi)業(yè)一周年的慶典，屆時(shí)會(huì )場(chǎng)將展出名貴的鉆石阿緹密斯之淚。理所當然，這顆鉆石吸引了怪盜基德的注意，他再次發(fā)出盜竊預告。雖然中森警部作了周密部署，卻依然防不勝防，阿緹密斯之淚最終失竊。與此同時(shí)，柯南、小蘭等人也受鈴木園子之邀參加了酒店的周年慶典。中森警部的出現引起柯南警覺(jué)，他繼而發(fā)現基德的計劃。
　　狡猾的基德接連逃脫中森警部和柯南的圍阻，不過(guò)卻在少年偵探三人組元太、步美、光彥的面前大失身手，還暴露了真容，不過(guò)卻被步美他們認作新一。另一方面，丟失了鉆石的酒店方似乎另有企圖……

　　一個(gè)比素子還暴力且暴露的火星女警和她的只是表面像巴特的大塊頭搭檔追查一宗謀殺案，身為著(zhù)名歌手的受害者被發(fā)現是機器人，于是案情變得撲朔迷離起來(lái)。