劇集以隱形任務(wù)戰略部隊及反恐特勤隊作為劇集主題，講述一眾反恐精英與不法份子掀起連場(chǎng)激斗的故事。

　　諸葛正我（馬德鐘 飾）、元十三限（歐錦棠 飾）和天依居（陳錦鴻 飾）是情同手足的同門(mén)師兄弟，其中，天依居自知無(wú)法在武學(xué)上有所造詣，所以退而求其次，開(kāi)始研究起了奇門(mén)遁甲。而諸葛正我和元十三限都是習武的人才，兩人水平不分高下，是師門(mén)中勢均力敵的對手。
　　令元十三限感到遺憾的是，直到學(xué)成下山，他都未能夠打敗諸葛正我，因此對此格外執著(zhù)，下山之后，元十三限選擇隱居山林精進(jìn)武藝，并將諸葛正我視為唯一的對手。而諸葛正我則投身于朝廷之中，為國效力。與此同時(shí)，一位名叫小靜（佘詩(shī)曼 飾）的女子走進(jìn)了兩人的生活，令兩人之間的矛盾再度升級。

　　1897年，大韓帝國時(shí)代動(dòng)蕩混沌，時(shí)有不同罪案發(fā)生，別巡檢調查隊四出調查，找尋破案的線(xiàn)索。
　　別巡檢第2季的時(shí)代背景為1897年大韓帝國的國號宣布之后，比第1季還要遲些。高宗自俄羅斯回國后自稱(chēng)為皇帝，由此朝鮮便變?yōu)榈蹏?，以闡明國家的自主性和獨立性。并且施行了財政、教育、軍事等幾乎全方位的光武改革，令朝鮮向現代化邁進(jìn)了一大步。因此這個(gè)時(shí)期應該是比第1季更為激動(dòng)人心的時(shí)期，然而大韓帝國所追求的新價(jià)值，讓國民看到的卻是比任何時(shí)候都強大的同一與自主的混亂。

　　調皮伶俐的少女與一（宮崎あおい 飾）生于人杰輩出的薩摩。適逢歷史變革的動(dòng)蕩時(shí)代，經(jīng)過(guò)長(cháng)達兩百多年的鎖國，日本國內各方面早已出現僵化腐敗的局面；而海外列強紛紛崛起，開(kāi)始將觸角伸向這個(gè)古老而神秘的國度。由于和外界多有接觸，以薩摩為代表的一部分有識之士渴望幫助日本成為現代化的強國，為此他們不惜采用各種手段改變國家的現狀。
　　島津齊彬（高橋英樹(shù) 飾）欣賞與一的聰慧與見(jiàn)地，于是將其收為養女，希望培養出一個(gè)能從幕府內部改革政府、引導國家走向的女子。肩負著(zhù)歷史使命，更名為篤子的與一開(kāi)始了將軍夫人的艱苦磨練。從此，她的人生將與齊彬、家定（堺雅人 飾）、大久保利通、西鄉隆盛（小澤征悅 飾）、慶福（松田翔太 飾）、勝海舟（北大陸欣也 飾）、小松帶刀（瑛太 飾）、慶喜（平岳大 飾）等一系列在幕末明治時(shí)代占有重要歷史地位的人物緊緊糾纏在一起……

　　《緊急救命》里的菜鳥(niǎo)實(shí)習醫生們，不再是剛來(lái)時(shí)手忙腳亂的樣子，各人都有了不小的成長(cháng)和變化，也加深了困惑。藍澤（山下智久 飾）糾結于家庭；白石（新垣結衣 飾）看似變得自信，實(shí)則仍對牽連黑田醫生（柳葉敏郎 飾）一事感到愧疚；緋山（戶(hù)田惠梨香 飾）因為之前救援意外受傷而留下了傷疤，害怕手術(shù)；滕川（前利陽(yáng)介 飾）依然是他們幾個(gè)當中最一般的人；而護士?jì)陯u（比嘉愛(ài)末 飾）則和患病的男友面對生死離別。醫院方面取代黑田的是新調來(lái)的醫生桔啟輔（椎名桔平 飾），和黑田的風(fēng)格完全不同。新的挑戰接踵而來(lái)，是去是留依然是個(gè)未知數。
　　《緊急救命》第二季再開(kāi)。上一季著(zhù)重講他們各自的成長(cháng)，而到了第二季則更多的講到了醫患關(guān)系，經(jīng)歷了不少生離死別和無(wú)能為力后，成為醫生的初衷是否能經(jīng)受的住現實(shí)的打擊，且他們對“醫生”一詞又有了新的認識。